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Installer MPICH2 avec Intel Fortran

Ce tutoriel vous explique comment installer la librairie mpich2 avec le compilateur Intel Fortran 12.1.

Cette procédure d'installation est effectuée sur la version 12.04 ubuntu avec le compilateur Intel Fortran 12.1.

Pré-requis

Il faut que le répertoire CHEMIN_VERS/intel/12.1/bin soit dans PATH et que ldconfig ait dans son cache CHEMIN_VERS/intel/12.1/lib

Procédure d'installation

Préparer mpich2

Télécharger les sources sur le site officiel MPICH2 puis décompressez l'archive obtenue.(Version actuelle : 1.5)

Ouvrez un terminal et placez vous dans le dossier extrait.

Configurer & compiler mpich

Fixer les variables d'environnement suivantes :

en sh (ksh, bash, etc)

export F77='ifort'
export FC='ifort'
export CC='icc'

en csh (tcsh, etc)

setenv F77 ifort
setenv  FC ifort
setenv  CC icc

ou, si vous ne disposez pas du compilateur intel fortran :

export CC='gcc' ou setenv CC gcc

Si on suppose que l'installation se fait dans le répertoire /opt/mpich2-intel, on peut alors taper les commandes suivantes :

./configure --prefix=/opt/mpich2-intel  --enable-fast-O3  --enable-f77  --enable-fc  --enable-mpe
make
sudo make install

Attention, si vous désirez compiler toutes les options de debug, fonctionnalités de librairie partagée gcc etc… reportez vous à la doc d'installation de MPICH2

À la suite de ces commandes, si votre compilation s'est passée sans erreur, vous devez obtenir un répertoire /opt/mpich2-intel.

Intégration dans l'environnement

Pour faciliter la vie aux utilisateurs, nous allons ajouter dans l'environnement l'accès à ces nouveaux outils :

Dans le fichier /etc/bash.bashrc, ajoutez les lignes :

if [ -d /opt/mpich2-intel/bin ]; then
  export PATH=$PATH:/opt/mpich2-ifort/bin
fi

Puis nous allons ajouter les librairies mpich2 à ldconfig en créant un nouveau fichier dans le répertoire /etc/ld.so.conf.d/.

Éditez le fichier /etc/ld.so.conf.d/mpich2.conf pour y entrer :

/opt/mpich2-intel/lib

Recharchez ldconfig par la commande :

sudo ldconfig

Conclusion

Cette installation est maintenant terminée et doit fonctionner. Vous pouvez effectuer des tests pour vérifier si tout cela marche en utilisant le répertoire exemples fourni avec le source de mpich2.

Attention, veillez à utiliser mpif90 ou mpif77 pour la compilation des codes sources . Ces commandes incluent toutes les options nécessaires aux compilateurs pour la bonne génération de vos codes parallèles .

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