Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- sim4 [Le 17/11/2016, 18:54]
2.2.47.220 [Sim4]
+++ sim4 [Le 27/06/2017, 19:58]
gotgot [Sim4]
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 ====== Sim4 ======
-Sim4 est un outil en invite de commande se basant sur les similitudes pour aligner une séquence d'ADN exprimée (EST, ADNc, ARNm) avec une séquence génomique pour un gène. Il détecte également les correspondances de terminaisons lorsque deux séquences entrées se recouvrent sur une terminaison.
+Sim4 est un outil en invite de commande se basant sur les similitudes pour aligner une séquence d'ADN exprimée (EST, ADNc, ARNm) avec une séquence génomique pour un gène. Il détecte également les correspondances de terminaisons lorsque deux séquences entrées se recouvrent sur une terminaison. il utilise la technique du[[ http://dna.cs.byu.edu/bio365/assignments/text6.shtml|BLAST]]
 ===== Installation =====
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      * [[http://globin.cse.psu.edu/html/docs/sim4.html|Information sur sim4]]
      * [[http://gamay.univ-perp.fr/analyse_seq/sim4|Online]]
+     * [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4101998/|(en) Utilisation]]
      * [[http://sibsim4.sourceforge.net/|SIBsim4 (basé sur sim4)]] (([[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|Installez le paquet]] **[[apt>sibsim4|sibsim4]]**.))