Bioinformatique sous Linux

Les modules Biopython et Bioperl regroupent un ensemble de bibliothèques pour les langages python et perl. Ces modules proposent des outils variés tels que l'interaction avec des bases de données biologiques publiques, la manipulation, l'annotation de séquences…

Manipulation de séquences biologiques

Alignements de séqences

Le paquet apt://blast2 permet d'installer en local la célèbre suite d'outils développée par le NCBI.

design d'oligonucléotides

Le logiciel primer3 (apt://primer3, http://frodo.wi.mit.edu/primer3/) permet le design d'oligonucléotides en prenant en compte de multiples critères (%GC, autocomplémentarité, taille de fragment…).


Contributeur : nesthib

  • bioinformatique.txt
  • Dernière modification: Le 17/02/2012, 10:50
  • par YoBoY