Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- r [Le 15/01/2017, 08:47] – tags et nettoyage de la page L'Africain
+++ r [Le 25/06/2026, 16:58] (Version actuelle) – [Ajout d'une bibiothèque] bcag2
@@ Ligne 1: / Ligne 1: @@
-{{tag>Xenial éducation calcul_numérique}}
+{{tag>Xenial Bionic éducation calcul_numérique}}
 ----
@@ Ligne 16: / Ligne 16: @@
 ===== Installation =====
+==== Via les dépôts Ubuntu ====
 L'installation de **R** est très simple : il suffit d'[[:gestionnaire_de_paquets|installer le paquet]] **[[apt>r-base]]**.
 R dispose de nombreuses fonctions supplémentaires disponibles sous la forme de paquets téléchargeables (un peu comme ubuntu). Pour pouvoir installer certains de ces paquets, il vous faut de quoi les compiler. C'est pourquoi il est aussi conseillé d'[[:gestionnaire_de_paquets|installer le paquet]] **[[apt>r-base-dev|r-base-dev]]**.
+==== Via un mirroir du CRAN (version plus récente) ====
+Source : [[https://mirror.ibcp.fr/pub/CRAN/]]
+<code>
+# update indices
+apt update -qq
+# install two helper packages we need
+apt install --no-install-recommends software-properties-common dirmngr
+# add the signing key (by Michael Rutter) for these repos
+# To verify key, run gpg --show-keys /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc
+# Fingerprint: E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
+wget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo tee -a /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.asc
+# add the R 4.0 repo from CRAN -- adjust 'focal' to 'groovy' or 'bionic' as needed
+add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu $(lsb_release -cs)-cran40/"
+</code>
 ==== Installer une interface graphique ====
-[[http://www.rstudio.org/|RStudio]] est un nouvel environnement de développement intégré. RStudio propose de nombreuses fonctionnalités intéressantes, telles la coloration syntaxique, la gestion des fichiers Sweave et LaTeX, un tableur, un gestionnaire de librairies, etc. Pour l'installer, il suffit de télécharger le fichier .deb sur le site de [[http://www.rstudio.org/download/desktop|RStudio]] et de l'ouvrir à l'aide de la logithèque Ubuntu (option par défaut).
+[[https://www.activestate.com/komodo-ide/downloads/edit|Komodo Edit]] est un éditeur polyvalent et //open-source//  qui peut être mis en interface avec R grâce au module complémentaire [[http://www.sciviews.org/SciViews-R/|SciViews-R]].
+[[http://www.rstudio.org/|RStudio]] est un nouvel environnement de développement intégré. RStudio propose de nombreuses fonctionnalités intéressantes, telles la coloration syntaxique, la gestion des fichiers Sweave et LaTeX, un tableur, un gestionnaire de librairies, etc. Pour l'installer, il suffit de télécharger le fichier .deb sur le site de [[http://www.rstudio.org/download/desktop|RStudio]] et de l'ouvrir à l'aide de la logithèque Ubuntu (option par défaut).
 [[http://rkward.sourceforge.net/|RKward]] est une interface graphique de R pour KDE. [[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|Installez le paquet]] **[[apt>rkward]]** pour en bénéficier.
@@ Ligne 30: / Ligne 50: @@
 [[http://rgedit.sourceforge.net/|rgedit]] est un plugin pour utiliser R avec [[gedit]]. Pour l'installer, télécharger la dernière version sur le site, extraire les fichiers dans .gnome2/gedit/plugins puis activer le pluging dans gedit, Édition-> Préférences->Greffons
 [[http://www.walware.de/goto/statet|StatET]] est un plugin pour utiliser R avec Eclipse. Il permet une reconnaissance syntaxique, offre un explorateur d'objet... Pour l'utiliser il faut installer le package rJava au préalable.
 On peut aussi utiliser [[:emacs]] avec le mode ESS (emacs speaks statistics).
@@ Ligne 43: / Ligne 63: @@
 Comme première approche, on peut simplement regarder les démonstrations des fonctionnalités du logiciel:
 <code>R
-   R version 2.8.1 (2008-12-22)
+   R version 4.3.3 (2024-02-29)
   [skip]
    > demo() #montre toutes les démos disponibles
@@ Ligne 70: / Ligne 90: @@
 Vous pourrez ensuite faire les mises à jours nécessaires des bibliothèques.
+==== Ajout d'une bibiothèque ====
+<code>
+sudo R
+# puis par exemple pour installer la bibliothèque stringr (le `>` en début de ligne est pour reproduire qu'on est dans R est non plus dans le shell) :
+> install.packages('stringr')
+# on peut lister les bibliothèques installées avec :
+library()
+</code>
+<note tip>si vous avez besoins de paquets particuliers (par exemple //tidyverse//), cela peut-être plus compliqué((https://stackoverflow.com/a/79966883/6614155))… la mise en œuvre d'un conteneur [[:docker]] peut-être plus approprié</note>
 ===== Premiers pas =====
@@ Ligne 99: / Ligne 130: @@
 ==== En anglais ou autre ====
   * Vous trouverez la documentation officielle [[http://cran.univ-lyon1.fr/manuals.html|ici]].
-  * On peut aussi consulter le wikibook [[http://en.wikibooks.org/wiki/R_Programming|R programming]].
+  * On peut aussi consulter le wikibook [[https://en.wikibooks.org/wiki/R_Programming|R programming]].
 ===== Aide et support =====
 === En français ===
-  * [[http://abcdr.guyader.pro/|L'abcdR]] scripts et astuces R
+  * [[https://larmarange.github.io/analyse-R|analyse-R]] une série de tutoriels très complets et accessibles aux débutants sur l'analyse de données avec **R**
-  * [[http://forums.cirad.fr/logiciel-R/index.php|Forum Web]] hébergé par le Cirad
+  * [[http://abcdr.guyader.pro/|L'abcdR]] scripts et astuces **R**
+  * [[https://forums.cirad.fr/logiciel-R/index.php|Forum Web]] hébergé par le Cirad
   * [[http://www.developpez.net/forums/f1179/autres-langages/autres-langages/r/|Forum Web]] du site developpez.net
   * Canal IRC francophone sur R : #Rfr sur irc.freenode.net, ou via une [[http://java.freenode.net/index.php?channel=Rfr|interface Web]] (en Java)
+  * [[https://www.youtube.com/watch?v=sav3Mbe0_DM|Le Chat septique explique les bases de R et RStudio]]
 ===== Sources =====

Différences

Outils de la page

Outils du site

Divers