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fah [Le 10/03/2008, 04:36]
YannUbuntu lien TeamUbuntu
fah [Le 31/08/2022, 23:33] (Version actuelle)
moths-art Passage de http à https sur les liens externes (détecté et corrigé via le bot wiki-corrector (https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=2067892)
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-{{tag>dapper edgy feisty gutsy divers}}+{{tag>calcul_collaboratif}}
  
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 =====  Introduction ===== =====  Introduction =====
  
-Folding@Home est un projet de distribution de données à plusieurs ordinateurs qui étudie ​ le repliement des protéines, les repliements anormaux, l’agrégation des protéines, et les maladies liées. L'​idée est d'​utiliser des méthodes informatiques nouvelles et une répartition des données aux ordinateurs dit "​distribués"​ à grande échelle pour simuler des échelles de temps des milliers voire des millions de fois plus longues que celles qu’on réalisait auparavant. Cela nous a permis de simuler un repliement pour la première fois, et de mener désormais notre recherche vers l’étude des maladies associées.+[[http://​folding.stanford.edu/​French/​Main|Folding@Home]] est un projet de distribution de données à plusieurs ordinateurs qui étudie ​ le repliement des protéines, les repliements anormaux, l’agrégation des protéines, et les maladies liées. L'​idée est d'​utiliser des méthodes informatiques nouvelles et une répartition des données aux ordinateurs dit "​distribués"​ à grande échelle pour simuler des échelles de temps des milliers voire des millions de fois plus longues que celles qu’on réalisait auparavant. Cela nous a permis de simuler un repliement pour la première fois, et de mener désormais notre recherche vers l’étude des maladies associées.
  
  
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 =====  Installation et paramétrage ===== =====  Installation et paramétrage =====
  
-Il existe plusieurs méthodes pour installer F@H sur Ubuntu. Ci-dessous nous présenterons l'​installation manuelle. +Il existe plusieurs méthodes pour installer F@H sur Ubuntu :
-Voir aussi les autres méthodes sur la page de [[https://​help.ubuntu.com/​community/​FoldingAtHome|Documentation Ubuntu]] (en anglais), notamment:+
  
-- l'​installateur semi-officiel [[https://​help.ubuntu.com/​community/​FoldingAtHome/​finstall|finstall]] qui permet de faire tourner F@H en Daemon ​(sans fenêtre).+==== Installation via Origami ​(paquet inclus dans les dépôts)====
  
-- l'​installateur ​pour réseaux [[https://​help.ubuntu.com/​community/​FoldingAtHome/​folding.sh|folding.sh]] +(pour pc local et réseaux
 +     ​* ​[[:origami|Installation et lancement automatique avec l'​installateur Origami]] inclus dans les dépots d'​Ubuntu.
  
 +==== Installation via finstall ====
 +
 +(pour pc local seulement)
 +     * [[:​fah_finstall|Installation et lancement automatique avec l'​installateur finstall]]. ​
  
 ==== Installation manuelle ==== ==== Installation manuelle ====
  
-== Telechargement et installation du client ==+(pour pc local seulement)
  
-  ​Par exemple dans /home/[utilisateur]/fah  +pour 32bits et 64 bits: 
-  +     * [[:​fah_installation_manuelle|Installation manuelle et lancement automatique]
-  mkdir ~/fah+
  
-  * Télécharger le client F@H dans le dossier nouvellement créé ​ 
  
-  cd ~/fah +===== Suivi du travail en cours ===== 
-  ​wget http://www.stanford.edu/group/pandegroup/release/FAH504-Linux.exe+Il existe plusieurs applications graphiques de suivi: 
 +  ​* [[http://prothink.sourceforge.net/|Protein Think]] 
 +  * [[http://fahmon.net/|FahMon]] (pour l'​installation voici [[http://​ubuntuforums.org/​showthread.php?​t=703180|un sujet du forum anglais]] qui s'​inspire de [[http://​trac.fahmon.net/​wiki/​CompilingForLinux|cette page officielle]])
  
 +===== Limitation de l'​utilisation CPU====
  
-  * Changer les droits ​du fichier+  * [[:​cpulimit]] : permet de limiter l'​utilisation ​du ou des processeur(s) par un processus déjà lancé ou qui le sera. 
 +  * (en) [[https://​ubuntuforums.org/​showthread.php?​t=992706|Discussion à propos de l'​utilisation de l'​utilitaire cpulimit avec F@H]]
  
-  chmod +x FAH504-Linux.exe+===== TeamUbuntu (45104) =====
  
-  * Exécuter le programme afin de paramétrer F@H ([[http://​folding.extremeoverclocking.com/​team_list.php|Liste des équipes]], ​[[https://​wiki.ubuntu.com/​FoldingAtHomeTeamUbuntu|Team-Ubuntu]]: 45104, ou bien Alliance-Francophone:​ 51, ou Linux: 163 ou ...)+Si vous aimez Ubuntu, vous pouvez choisir ​de rejoindre la [[https://​wiki.ubuntu.com/​FoldingAtHomeTeamUbuntu|TeamUbuntu]] en choisissant l'​équipe n°45104 lors de votre installation.
  
-  ./​FAH504-Linux.exe -configonly +===== Liens utiles ​=====
- +
-  * Entrer les infos requises  +
- +
- +
- +
-== Création du fichier de demarrage automatique  ​== +
- +
-  * Créer un fichier nommé fah dans le dossier /​etc/​init.d +
- +
-  sudo gedit /​etc/​init.d/​fah +
- +
-  * Maintenant, copier les infos suivantes à l'​intérieur +
- +
-  #!/bin/sh +
-  # /​etc/​init.d/​fah for Ubuntu +
-  # Start/​stop/​restart the F@H service. +
-   +
-  export FAH_HOME=/​home/​[utilisateur]/​fah +
-   +
-  fah_start() { +
-  if [ -x "​$FAH_HOME/​startfah.sh"​ ]; then +
-  echo "​Starting F@H: $FAH_HOME/​startfah.sh"​ +
-  "​$FAH_HOME/​startfah.sh"​ +
-  fi +
-  } +
-   +
-  fah_stop() { +
-  sudo killall FAH504-Linux.exe +
-  } +
-   +
-  fah_restart() { +
-  fah_stop +
-  sleep 2 +
-  fah_start +
-  } +
-   +
-  case "​$1"​ in +
-  '​start'​) +
-  fah_start +
-  ;; +
-  '​stop'​) +
-  fah_stop +
-  ;; +
-  '​restart'​) +
-  fah_restart +
-  ;; +
-  *) +
-  fah_start +
-  esac +
- +
- +
-Sauvegarder et fermer gedit. +
- +
-  * Changer les droits du fichier +
- +
-  sudo chmod +x /​etc/​init.d/​fah +
- +
- +
-== Démarrage automatique au lancement d'​Ubuntu == +
- +
-  * Maintenant, nous allons créer le script startfah.sh +
-  +
-  gedit ~/​fah/​startfah.sh +
- +
-  * Copier les informations suivantes à l'​intérieur  +
- +
-  #!/bin/sh +
-   +
-  export FAH_HOME=/​home/​[utilisateur]/​fah +
-   +
-  cd $FAH_HOME +
-  $FAH_HOME/​FAH504-Linux.exe >/​dev/​null 2>&1 & +
-  exit 0 +
-  +
-Vous pouvez ajouter les paramètres -forceasm et -advmethods ou d'​autres ... +
- +
-Plus d'​infos sur (en anglais) : [[http://​www.liquidninjas.com/​bbs/​showthread.php?​t=3270]] +
- +
-  * Changer les droits du fichier  +
- +
-  chmod +x ~/​fah/​startfah.sh +
- +
- +
- +
-  * Etape finale, créer un lien dans ///​etc/​rc2.d//​ +
- +
-  sudo ln -s /​etc/​init.d/​fah /​etc/​rc2.d/​S99fah +
- +
-Pour tester le script, rebooter ou entrer la commande : +
- +
-  sudo /​etc/​init.d/​fah start +
- +
-Lancer le moniteur système, l'​utilisation CPU doit être a 100% !!! +
- +
- +
-== Remarques == +
- +
-  * 1- Si le programme ne se lance pas à la session suivante, revérifier chacune des étapes. Si tout est correct, essayer la manipulation suivante: +
- +
-  sudo apt-get install bum +
- +
-Pour Ubuntu « Gutsy Gibbon » 7.10 il suffit de [[apt://​bum|cliquer ici]]. +
- +
-Ensuite, aller dans Système->​Administration->​BootUp Manager +
-Vérifier que le script fah soit bien présent dans la liste et coché. On peut également démarrer/​arrêter le service depuis ce programme si besoin. +
- +
-Une fois coché, valider les changements et relancer la session. Le programme Folding@Home devrait se lancer. +
- +
-Relancer le script +
- +
- +
-===== Suivi du travail en cours =====+
  
-  * Différents outils permettant par exemple de suivre l'​évolution du travail ​en cours sont disponible ​sur [[http://​forum.folding-community.org/​viewtopic.php?​t=11700|cette page]] +  * [[https://​help.ubuntu.com/​community/​FoldingAtHome|F@H sur Documentation Ubuntu (en anglais)]] 
-  * Exemple de suivi graphique: ​[[http://sourceforge.net/project/screenshots.php?group_id=164311|Protein Think]] +  * [[https://​forum.ubuntu-fr.org/​viewtopic.php?​id=6803|Topic de discussion F@H sur le forum Ubuntu-fr]] 
 +  * [[http://​forum.folding-community.org/​viewtopic.php?​t=11700|Folding forum (anglais)]] 
 +  * [[http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=teampage&​teamnum=45104|Statistiques de la TeamUbuntu]]
  
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-//​Contributeurs : Traduit/​Rédigé par [[utilisateurs:​dukiclock]] et[[utilisateurs:​YannUbuntu]]+//​Contributeurs : Traduit/​Rédigé par [[utilisateurs:​dukiclock]] et [[utilisateurs:​YannUbuntu]]
 Remarques et commentaires ​ sur le [[http://​forum.ubuntu-fr.org/​viewtopic.php?​pid=44821#​p44821|forum Ubuntu-fr]].//​ Remarques et commentaires ​ sur le [[http://​forum.ubuntu-fr.org/​viewtopic.php?​pid=44821#​p44821|forum Ubuntu-fr]].//​
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  • Dernière modification: Le 10/03/2008, 05:02
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